Il sequenziamento di prossima generazione chiarisce la storia naturale della infezione da virus della epatite C nei pazienti in cui il trattamento fallisce
Alti tassi di infezione a trasmissione sessuale e reinfezione da virus dell'epatite C ( HCV ) sono stati recentemente segnalati in uomini infettati da virus della immunodeficienza umana ( HIV ) che hanno rapporti sessuali con uomini e la reinfezione è stata anche descritta in consumatori monoinfetti di sostanze stupefacenti iniettabili.
La diagnosi di reinfezione si è tradizionalmente basata sul sequenziamento diretto di Sanger dei campioni pre-trattamento e post-trattamento, ma non su tecniche di sequenziamento profonde più sensibili.
Sono state studiate le dinamiche di quasispecie virali in pazienti in cui è fallita la terapia standard in una coorte di pazienti ad alto rischio con infezione da virus HIV e da virus HCV, in fase precoce, per determinare se il fallimento del trattamento sia risultato associato a reinfezione o recrudescenza di infezione preesistente.
Sono state analizzate le sequenze appaiate ( pre- e post-trattamento ).
La regione ipervariabile-1 della proteina E2 di HCV è stata amplificata mediante PCR a trascrittasi inversa nidificata ( RT-PCR ) con specifici primer, e gli stessi prodotti sono stati sequenziati usando approcci Sanger e pirosequenziamento 454.
Dei 99 pazienti con infezione da HIV e con infezione acuta da HCV trattati con 24-48 settimane di Interferone alfa pegilato e Ribavirina, 15 non sono riusciti a raggiungere una risposta virologica sostenuta ( 6 hanno recidivato, 6 hanno avuto una risposta nulla e 3 una risposta parziale ).
Utilizzando il sequenziamento diretto, 10 pazienti su 15 ( 66% ) hanno mostrato un ceppo precedentemente non-rilevato post-trattamento; in molti studi, questo viene interpretato come reinfezione.
Tuttavia, il pirosequenziamento ha rivelato che 15 pazienti su 15 ( 100% ) avevano evidenza di infezione persistente; 6 su 15 ( 40% ) avevano evidenza di una variante precedentemente non-rilevata presente nel campione dopo il trattamento, oltre a una variante che è stata rilevata al basale.
Questo potrebbe rappresentare una superinfezione o una limitazione della sensibilità del pirosequenziamento.
In conclusione, in questo gruppo ad alto rischio, l'emergere di nuovi ceppi virali dopo il fallimento del trattamento è più comunemente associato a un emergente predominio di varianti di minoranza preesistenti piuttosto che a reinfezione.
La superinfezione può verificarsi in questa coorte, ma la reinfezione è sovrastimata dal sequenziamento di Sanger. ( Xagena2015 )
Abdelrahman T et al, Hepatology 2015; 61: 88-97
Gastro2015 Inf2015
Indietro
Altri articoli
Efficacia dell'inibizione del checkpoint dopo il fallimento della terapia CAR-T nei linfomi aggressivi a cellule B
La terapia con inibitori del checkpoint ( CPI ) con anticorpi anti-PD-1 è stata associata a esiti contrastanti in piccole...
Studio ALLELE: Tabelecleucel nei destinatari di trapianto di organi solidi o di cellule emopoietiche allogeniche con malattia linfoproliferativa post-trapianto indotta da virus di Epstein-Barr dopo fallimento di Rituximab o di Rituximab più chemioter
Tabelecleucel è un'immunoterapia a cellule T specifica per il virus di Epstein-Barr ( EBV ) allogenico, studiata nei pazienti con...
Potenziali mediatori della neuropatia periferica indotta da Oxaliplatino nella terapia adiuvante nel tumore del colon in stadio III: studio CALGB Alliance/SWOG 80702
Sono state valutare le associazioni indipendenti e interattive di durata del trattamento pianificato, uso di Celecoxib, attività fisica, indice di...
Enzalutamide più Abiraterone versus Enzalutamide nel tumore alla prostata metastatico resistente alla castrazione: studio Alliance A031201
Enzalutamide ( Xtandi ) e Abiraterone ( Zytiga ) sono entrambi mirati alla segnalazione del recettore degli androgeni, ma attraverso...
Prednisone versus placebo e parto vivo nelle pazienti con fallimento di impianto ricorrente sottoposte a fecondazione in vitro
Il fallimento dell'impianto rimane una barriera fondamentale per la fecondazione in vitro. Il Prednisone, come agente immunoregolatore, è ampiamente utilizzato...
Intervalli salutari ottimali della funzione tiroidea definiti dal rischio di malattie cardiovascolari e mortalità
Gli intervalli di riferimento dell'ormone stimolante la tiroide ( TSH ) e della tiroxina libera ( FT4 ) sono definiti...
Ablazione a ultrasuoni focalizzata del globo pallido nella malattia di Parkinson
L'ablazione ecografica focalizzata, unilaterale, del segmento interno del globo pallido ha ridotto i sintomi motori della malattia di Parkinson in...
Recidiva locale dopo terapia conservativa del seno nei pazienti con tumore mammario ipsilaterale multiplo: studio ACOSOG Z11102 ( Alliance )
La terapia conservativa del seno ( BCT ) è il trattamento preferito per il tumore mammario ( BC ) unifocale....
Sebetralstat, un inibitore orale sperimentale della callicreina plasmatica per il trattamento su richiesta dell'angioedema ereditario
Le linee guida raccomandano una terapia on-demand efficace per tutti gli individui con angioedema ereditario. È stato valutato il nuovo...
Valutazione della sicurezza e dell’equivalenza a breve termine della Colchicina rispetto al Prednisone nei pazienti anziani con artrite acuta da cristalli di pirofosfato di calcio: studio COLCHICORT
L’artrite acuta da cristalli di pirofosfato di calcio causa un intenso dolore articolare che colpisce soprattutto le persone anziane. Poiché...